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氧化性杀菌灭藻剂是一种具有强烈氧化性的杀生剂，对水中的微生物的杀生作用强烈。当水中存在有机物、硫化氢、亚铁离子时，会消耗掉一部分氧化性杀生剂，降低它们的杀生效果。
氧化性杀菌灭藻剂的作用：
氯的杀菌作用是氯在水中生成分子状态的次氯酸，次氯酸分子能穿透微生物的细胞膜与蛋白质生成稳定的N-CL键，使呼吸作用所一定要有的还原酶减弱或失去活性，较高浓度时会破坏细胞壁。添加到水中的氯以次氯酸的形式存在的比例越高，杀菌效果越好。
氯处理的效果很快，水中的原生动物（如草履虫和纤毛虫）和轮虫等，通氯之后很快就被杀死。藻类比细菌更容易被氯杀死，加氯的浓度达1mg/L，就能杀死大部分藻类。使蓝藻和硅藻致死的氯浓度分别为0.5-1.01mg/L和0.1-1.01mg/L。
